管委会设立专项资金，用于建设“四个中心”，服务“246”产业集群发展，支持“246”产业企业利用保税区功能政策和产业平台促进全产业链创新发展。
（一）促进研发创新。推进跨境研发便利化，充分发挥全产业链保税研发创新、离岸创新孵化等功能，对境外入区研发货物、物品免于提交许可证，进口消耗性研发材料按实耗核销；对“246”产业企业在区内新设研发设计企业，符合有关标准的，海关直接赋予最高信用等级。
（二）建设创新高地。发挥区域功能政策优势，鼓励“246”产业企业设立创新中心、技术中心、设计中心和创新实验室等研发机构，对年度自主研发实际投入超过100万元（含）以上的，给予实际研发费用8%的资金补助，最高不超过800万元补助。
（三）支持医疗设备研发。“246”产业企业在区内开展医疗器械进口，用于研发、展示的，可不办理相关注册或备案手续；对具备条件的生物医药企业进口用于研发的药物、医疗器械样品，给予享受绿色通道，提供专项通关便利。
（四）开展全球检测维修服务。鼓励“246”产业企业在区内开展高技术、高附加值、符合环保要求的保税检测和全球维修业务。支持第三方检验检测机构在区内开展“246”产业相关产品的进出口检验认证服务。
（五）支持进口设备融资租赁业务。鼓励企业在区内开展“246”产业高端装备、智能设备等融资租赁业务，对进口租赁设备涉及跨关区的，在确保有效监管和执行相关税收政策前提下，按物流实际需要，实行海关异地委托监管。
（六）服务“246”产业数字化转型。鼓励全市“246”产业企业依托航天云网、百度云智大数据基地、保税区金融科技产业园等平台资源，开发与“246”产业深度融合的云制造、大数据、区块链解决方案，结合具体情况给予一定补助。
（七）鼓励设立进口采购中心。鼓励“246”产业企业在区内设立进口贸易服务平台，促进产业相关设备和原材料进口，对投资1000万元以上的平台项目，按照投资额10%给予补助，对“246”产业企业在区内开展设备及原材料进口，优先安排保税仓储，并给予一定仓库租金优惠。
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